自2016年5月15日起，沪九（上海至香港九龙）直通车运行时间有所调整，Z100次（香港九龙-上海）红磡站发车时间为15时15分，抵沪时间为次日10时37分；Z99次（上海-香港九龙）上海站发车时间为17时45分，到港时间为次日13时01分。
来源：上海边检微博
